SMP NEGERI 46 jAKARTA memfasilitasi berbagai macam kegiatan ekstrakurikuler untuk mewadahi dan mengembangkan minat dan bakat siswa dan siswi dalam berbagai bidang, mulai dari olah raga hingga seni dan budaya. Dengan kegiatan ini diharapkan siswa dan siswi tidak hanya mendapatkan ilmu dikelas namun juga ruang untuk menyalurkan hobi, membangun pertemanan dan mengembangkan bakat.